目前，临床医学信息学的研究领越来越广泛，设计科研，医疗，教学与管理。大致可分为如下几个方面：
1、医学信息基本问题：包括医学，尤其临床信息的获取、储存和利用以及医学信息学与临床医学信息学的学科属性，理论基础等。
2、医学实践的管理：包括医学信息的交换与远程通信，信息的储存与检索，数据的处理与自动化，医疗诊断与决策，疾病的治疗与控制以及临床研究与开发等。
3、现代信息技术在医学科研与统计中的应用：包括临床研究系统，计算机在分子生物学中的应用，神经网络以及SAS等各种统计分析中的应用。
4、现代信息技术在医学教育中的应用：包括计算机在医学教育中的应用，数字化解剖图谱及虚拟人体等。
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